福建医科大学是福建省重点建设高校之一，其前身是创办于年的福建省立医学专科学校。年改名为福建省立医学院。年改称福建医学院。年，与福建中医学院、华侨大学医疗系合并，成立福建医科大学。年更名为福建医学院。年4月更名为福建医科大学，教育部卓越医生教育培养计划试点高校。
学校拥有上街、台江2个校区，占地约亩，校舍建筑面积42万多平方米，办学主体位于福州地区大学新校区。学校已形成学士-硕士-博士人才培养体系，成为一所集教学、科研、医疗、预防和社会服务为一体的省属医科大学。
学校设有21个学院（部），28个本科专业，有6个一级学科博士学位授权点（涵盖目录内或自设二级学科42个），有2个博士专业学位授权点；有8个一级学科硕士学位授权点，有6个硕士专业学位授权点；2个博士后科研流动站，4个博士后工作站，2个院士工作站。
福建医科大学现有的上街和台江两个校区都在福建省福州市，为主动服务和融入地方经济建设与社会发展，助力健康福建建设和区域经济社会发展，学校正在谋划建设新校区。年7月15日上午，泉州市领导以及惠安县领导等人陪同福建医科大学校长陈晓春等人到泉州市惠安县黄塘镇实地考察为拟新建校区选址，对拟选址地块的地理位置、区域规划、交通条件和配套设施等情况进行详细了解和深入交流与探讨。
泉州市惠安县是福建省泉州市下辖的一个县，与晋江、南安，合称泉州三邑。惠安县位于福建省东南沿海，东北部介于泉州湾和湄洲湾之间，东临台湾海峡，辖境东北连泉州湾，西接洛江区，北邻泉港区，南隔泉州湾与晋江市相望。是闽南著名侨乡和台湾汉族同胞主要祖籍地之一。惠安海岸有黄金海岸之称，全长千米，占全省的6%，沿海港湾密布。
泉州市一共有7所本科院校，分别为华侨大学、泉州师范学院、仰恩大学、闽南科技学院、闽南理工学院、泉州职业技术大学和泉州信息工程学院。而7所泉州市本土高校中没有一所院校在惠安县建设校区的，也没有异地本科院校在惠安县建设新校区，福建医科大学在惠安县建设新校区将是整个惠安县第一个本科院校校区。